四、税务稽查的结案程序
税务稽查的结果有两种，第一种可能性是，纳税人的应纳税款都已经申报，纳税申报不存在任何错误，应纳税款不需要做任何调整。在这种情况下，税务局会正式确认纳税人的申报，给纳税人签发确认函（no change letter）。第二种可能性是，纳税人的确存在少申报的情形，需要对已申报的税收进行调整。而如果纳税人根本就没有申报纳税，则需要直接启动税收确定程序。在这种情况下，税务稽查的结案程序有两种，一种是协议结案，另一种是非协议结案，二者的具体要求有很大的不同。另外，对于特定的纳税人，还存在特定的调解和协商程序。
（一）协议结案
在机关稽查和现场稽查结束的时候，稽查人员会把税收调整的内容告知纳税人，以期得到纳税人的认可，从而以协议的方式结案。与此同时，稽查人员还会做成一份稽查报告，说明税收调整的内容及理由，以供主管人员审查。不过，在协议结案的方式下，稽查报告提交审查之前，可以先提供给纳税人。而在非协议结案的方式下，则必须先提交主管人员审查，然后才能提供给纳税人。
无论是纳税人表示同意税收调整的内容，还是稽查人员生成稽查报告，并将其提供给纳税人，或者将其提交主管人员审查，都不代表案件正式完结。一直要等到审查人员通过稽查报告，并且通知纳税人，表示愿意接受税收调整的内容，案件才会正式了断。纳税人需要做的，只是签署协议结案表（agreement forms），放弃对税收核定的限制，使税务局可以立即核定税收。
在正常的税收核定程序中，税务局必须先向纳税人寄发欠税通知，并给纳税人90天的等待期。如果纳税人90天之内不起诉，才能在期满后正式核定税款。如果纳税人起诉，则必须等税务法院作出裁决，并且等上诉期届满之后，才能正式核定税收。这些内容就属于法律对税收核定的限制。
而在协议结案的情况下，通过签署放弃税收核定限制的声明，这些限制就不复存在。税务局不必邮寄欠税通知，也不必受90天期限的限制，更不用担心纳税人起诉。相反，税务局可以直接核定税收，并且立即启动税收征收程序。这样，税收核定的时间就大大提前了。对纳税人而言，如果知道纳税申报存在缺陷，经不起税务局放大镜似的认真审查，通过协议结案，也可以了却不必要的纷扰。
税务稽查结案之后，随之而来的只是税收核定。协议结案只涉及税收核定的内容，并不强迫纳税人立即缴纳税款或利息。税务局会劝说纳税人主动提前缴纳税款，这样可以减少利息的累积，同时也节省后续的执行费用。不过，纳税人并没有法定义务一定如此。正常情况下，税收核定之后，税务局仍然必须进行催缴。催缴达不到目的时，才会启动强制执行程序。
（二）非协议结案
所谓非协议结案，是指纳税人不同意税收调整的内容，致使税务局单方确定税收数额，并据此完成税收核定的过程。
无论是在通信稽查、机关稽查，还是在现场稽查中，如果税务局不能与纳税人达成一致，就会向纳税人签发一份30日函。从法律性质上看，30日函只代表税务局的初步意见，是将税务局可能采取的行动，或者可能做出的决定，提前通知纳税人。如果纳税人对此不予理睬，期限届满之后，税务局才会下发欠税通知，即90日函。
联邦税务局在邮寄30日函时，还会同时寄发的文件包括：（1）税收稽查报告，说明税收调整的内容及原因；（2）放弃税收核定限制的声明，即上文所说的协议结案表；（3）关于救济程序的说明，包括如何申请行政复议，也包括如何向法院起诉。纳税人收到这些材料之后，可以根据具体的情况，决定在程序上如何应对。
纳税人可以放弃对税收核定的限制，允许税务局直接核定税款和利息。而税务局在寄送30日函时，之所以同时寄送“放弃税收核定限制的声明”，无非是希望尽量促成协议结案，提高行政效率，降低程序成本。纳税人按照要求缴纳税款及利息之后，仍然可以在法定时效之内向税务局请求返还。如果不准，还可以向联邦地方法院或索赔法院起诉。
如果纳税人不同意税收稽查报告的内容，不愿意与税务局协议结案，他可以在收到30日函之后30日之内，向联邦税务局复议部申请复议。在复议程序中，协议结案仍然受首选的考虑。复议部会尽量与纳税人协商，通过双方妥协的方式解决问题。如果不能达成协议，根据不同的案件类型，复议部可以直接核定税收，或者签发欠税通知。
如果纳税人不愿意申请复议，也可以静观其变。一般情况下，30日函寄出后45到60天之后，稽查人员会正式确定欠税，并向纳税人寄发欠税通知。假如纳税人不同意欠税通知的内容，可以先按照通知的要求缴纳欠税，然后向税务局申请退税。税务局不准时，再向联邦地方法院或索赔法院起诉。或者，纳税人可以直接向税务法院起诉，不必先行缴纳欠税。税务法院作出判决之后，不管纳税人是否上诉，在上诉期届满之后，税务局都可以立即核定税收。
（三）快速调解（Fast Track Mediation）和快速协商（Fast Track Settlement）程序
快速调解程序适用于小规模企业以及独立职业者。主持调解的是联邦税务局复议部官员。调解人固然独立于纳税人，但其身份也不同于税务局。调解人会尽量处于中立地位，调处纳税人与税务局之间的争议。如果能够达成调解协议，协议结案就会成为可能。而调解程序的周期一般不长，许多案子在一个月左右就能有结论。这比旷日持久的税务复议要快捷得多。即便不能达成调解协议，也不会过多地影响税务稽查的进程。对于大中型企业而言，其可以选择快速协商程序，在纠纷的早期就通过协商解决问题。这项程序从2001年11月14日起开始引入，对快速解决纠纷起到了很好的作用。
（四）结案书的法律效力
上文已经提到，在协议结案的情况下，纳税人必须填写“协议结案表（agreement form）”。在美国联邦税收程序中，这种协议结案表被标注为870表。纳税人签署870表格的效力是，放弃对税收核定或者征收的限制，使税务局可以立即核定或者征收税收。不过，这并不表示纳税人对于被核定的税收不能再争议。事实上，纳税人签署表格、缴纳欠税之后，仍然可以申请退还税收。这说明，协议结案表对纳税人并没有太大的约束力，仅仅使税务局立即核定税收具有了合法性。另一方面，只要没有超过税收核定时效，当纳税人申请退税时，税务局可以增加税收核定的数额。这说明，协议结案表对税务局也没有多大的约束力。
如果希望增加结案书的效力，使其对纳税人和税务局都具有约束力，在签署870表之后，纳税人最好和税务局达成最终结案书（final closing agreement）。这种结案书或者表现为866表，即“最终确定税收债务的协议”，或者表现为906表，即“关于特定事项最终确定的结案书”。尽管这个过程非常麻烦，需要耗费很长的时间，但是，对于纳税人来说，如果能够达成一个确定的结果，即使耗费一些代价也是值得的。最终结案书达成之后，除非出现非常特殊的情况，无论是纳税人还是税务局，都必须受此约束。纳税人不得对此进行争议，税务局也不得重新稽查或核定。
按照美国财政部规章的相关规定，已经达成最终结案书的案件，不得为了增加纳税人的税收，而对已经结案的年度进行重新稽查（reopen），除非：（1）有证据显示，案件存在欺诈（fraud）、渎职（malfeasance）、串通勾结（collusion）、隐瞒（concealment），或者重大事实的虚假陈述（misrepresentation of material fact）；（2）税务局有足够的依据确信，前一次稽查所达成协议存在明显的、确定无疑的实质性错误（clearly defined substantial error）；（3）如果不能重新稽查，会导致严重行政疏忽（serious administrative omission）的其他情形。重开税务稽查必须经过稽查部主任或者税务遵从部（Compliance Division）主任同意。如果需要再次检查纳税人的会计账簿，重新稽查开始时，稽查人员还必须向纳税人送达书面通知。（注：Treas. Reg.§601.105（j）.）