第一篇 绪论

第1章 人体微生物组

微生物群(microbiota)是特定时间特定生境所有微生物有机体的总称,其组成包括非细胞结构的病毒(含噬菌体)、原核生物中的真细菌和古细菌,以及真核细胞微生物。与之对应,微生物群可以划分为病毒群、细菌群、古细菌群和真核细胞型微生物群。而微生物组(microbiome)是特定时间特定生境中微生物群所包含的基因序列(含同源序列)的总和。两者不完全对应(图1-1,见文末彩图),微生物组的范围更广,特别是动物和植物微生物组。微生物组与其宿主基因组有重叠部分——主要是宿主基因组包含的与微生物同源的基因序列,特别是与病毒基因序列的同源部分。相应地,微生物组也可以分为病毒组、细菌组、古细菌组、真核细胞型微生物组。微生物组推动自然界过程的变化近年来受到广泛关注,涉及人体、动物、植物、水体、土壤、大气、农业和水产养殖、环境保护和新能源等诸多方面,目前对人体微生物组的研究取得的成果最为丰富。

图1-1 人体微生物群(A)与微生物组(B)示意图