口腔是人体中动态和独特的生态系统，其特征在于其生态条件的不稳定性。口腔由覆盖于角质化鳞状上皮（例如上腭）、非角化上皮以及舌与龈缘上方和下方的牙齿的硬的非脱落结构的黏膜组成。这些位点构成促进微生物发展的单独的生态位，每个生态位具有独特的微生物组。口腔微生物群落是与人体相关的最复杂的细菌群落之一。