抽动障碍患者可以伴有偏头痛（migraine）。Barabas等研究发现，儿童期偏头痛在抽动障碍组中的发生率比惊厥性疾病组和学习困难组显著增高，依次为26.6%（16/60），11.1% （8/72）和6.4%（4/62），而在一般学龄儿童中偏头痛的发生率则为4.0%～7.4%，认为伴有偏头痛的抽动障碍患者可能代表本病的一种亚型，其主要发病原因是以与5-羟色胺代谢功能障碍有关的神经递质紊乱为基础。抽动障碍和偏头痛在某些儿童中共存，可能反映两者有相似的代谢异常。