遗传代谢病在新生儿早期多数表现为非特异性症状，包括喂养困难、体重不增、嗜睡、呼吸异常、呕吐、惊厥、肌张力低下等，如表2-2所示。新生儿后期起病的遗传代谢病可表现为反复呕吐、进行性昏睡至昏迷、持续性低血糖、严重的新生儿黄疸及新生儿肝功能衰竭等。当早期看似“健康”的新生儿突然出现以上非特异性症状，并迅速恶化，临床表现为多样性或非特异性，用经典疾病不好解释，病情持续进展，传统处置效果不佳，亲代有近亲结婚、同胞新生儿死亡史，应该考虑遗传代谢病的可能，立即进行遗传代谢病检查以明确病因。

喂养困难可表现为：吸吮力差，吸吮与吞咽不协调，反复发生的溢奶与呛咳，体重增长缓慢。

无法解释的、持久的代谢性酸中毒是新生儿期IEM的常见特征。计算阴离子间隙（AG）有助于临床判断，AG正常的酸中毒限于那些与经肾或经肠道损失碳酸氢盐有关的疾病。有机酸血症和原发性乳酸性酸中毒引起的代谢性酸中毒AG常早期增高。大多数代谢性疾病在晚期阶段可因脑病和循环障碍导致酸中毒加重。

呼吸系统受累是IEM的表现之一，严重者常发生呼吸衰竭。可发生于发病的早期或晚期，可直接累及呼吸系统表现为喉喘鸣、呼吸急促、喘息、间质性肺炎和肺动脉高压等，呼吸异常可表现为呼吸节律、频率的异常，或呼吸困难。代谢性酸中毒、化学毒物及药物中毒可表现为深大呼吸，并有毒物接触史，应立即进行血气分析、血生化检查及毒物筛查。可因神经系统受累导致吞咽障碍引起吸入、累及周围神经肌肉导致呼吸肌无力，引起通气功能障碍。

伴有乳酸酸中毒的婴儿在诊断上存在困难，很高的血浆乳酸水平伴发于缺氧，由丙酮酸代谢紊乱和呼吸链缺陷引起，脂肪酸氧化紊乱、有机酸血症、尿素循环缺血等IEM也可伴发乳酸性酸中毒。由于止血带、哭闹、憋气等导致的静脉梗阻可以使血浆乳酸盐浓度增加2～3倍，因此，取动脉血标本可使检测更为可靠。新生儿如果无窒息和其他器官功能衰竭的证据，血浆乳酸盐浓度持续增高超过3mmol/L则应该进行IEM方面的检测。乳酸性酸中毒是一组复杂的疾病，许多缺陷是组织特异性的（如局限于肌肉或中枢神经系统）。许多婴儿死亡而诊断不明，故按正确方法采集皮肤、肌肉和肝标本进行酶学和DNA分析很有必要。

指累积的前体或代谢产物的毒性效应引起脑部和维持正常意识状态有关的神经元代谢障碍或弥漫性病理改变而发生的、急性的、危及生命的中枢神经系统疾病。是新生儿期最常见的IEM表现。可伴有或不伴有严重的代谢性酸中毒、高氨血症。这类患儿常在诊断进行的过程中死亡。

脑病和惊厥有两种可以辨别的表现模式。一种是新生儿出生时大致健康，经过一个无症状的过渡阶段后，表现出一些非特异的症状，如嗜睡、食欲缺乏、呕吐或易激惹，随后，可出现代谢性酸中毒或高氨血症，抽搐、昏迷变得越来越明显。新生儿正常血氨浓度<65μmol/L，但患儿的血氨浓度常常高达180μmol/L。有机酸血症（丙酸、甲基丙二酸及异戊酸血症）和尿素循环缺陷典型地以这种形式表现，并且呼吸性碱中毒都是最早的酸碱平衡紊乱。因为新生儿并不容易产生酮体，出现酮尿强烈提示IEM。

另一种主要表现为神经系统病变，而无明显的高氨血症和酸碱代谢紊乱。在无明显症状间期，新生儿表现为意识不清、抽搐和呼吸暂停等非特异症状。非酮性高甘氨血症、含钼元素辅酶缺乏、维生素B ₆依赖性惊厥、原发性乳酸中毒、线粒体和过氧化物酶体病变等疾病以这种形式表现。常导致严重的肌张力降低，伴或不伴有畸形或其他先天性异常。

全血血糖低于2.2mmol/L应诊断为新生儿低血糖。当新生儿低血糖发生在进食后、补充葡萄糖后症状不缓解、低血糖反复发作或者伴有其他代谢紊乱时，应考虑遗传代谢病可能。持续性低血糖常见病因包括：高胰岛素血症，先天性垂体功能不全，生长激素缺乏，皮质醇缺乏，胰高糖素缺乏，遗传代谢病（如：糖原贮积症Ⅰ型与Ⅲ型、中链酰基辅酶A脱氢酶缺乏、支链氨基酸代谢障碍、亮氨酸代谢缺陷）等。考虑遗传代谢病时应排除以下疾病：糖尿病母亲所生的婴儿、早产儿、小于胎龄儿、围产期缺氧与酸中毒、严重的感染、高胰岛素血症及先天性内分泌功能障碍。

表现为增殖性心肌病和心室扩张功能减退者，可能提示线粒体呼吸链缺陷、长链脂肪酸氧化障碍或Pompe病（GSDⅡ型）。多系统先天性糖基化病变（CDG）可在生后迅速出现心肌病和（或）心包渗液，其特征包括：身体瘦弱、面部畸形、乳头内陷和脂肪分布异常。X链锁扩张性心肌病、中性粒细胞减少症（Barth综合征）都有尿有机酸分析的特征性异常，可伴或不伴有心肌病，但大多数有心律失常。

半乳糖血症是引起新生儿期肝功能障碍的最常见的代谢性原因。除有肝病的症状外，早期发生的白内障很有提示性。其他少见的IEM如肝肾酪氨酸血症、抗胰蛋白酶缺乏、新生儿血色素沉着病和线粒体呼吸链缺陷也必须考虑。尼曼-匹克病C型（NPC）是一种细胞内胆固醇酯化作用缺陷导致的脂肪累积病，典型表现为儿童期神经退行性变；然而很大比例在神经病变出现之前，新生儿期即表现为不同程度的胆汁淤积、肝功能障碍和肝脾大等。

体温不稳定可以是Menkes综合征的早期特征。非免疫性水肿胎儿可以与许多代谢性疾病有关。黄疸和出血见于影响肝功能的疾病，但也可以是其他IEM，如尿素循环缺陷的晚期症状。