1573年4月由于武田信玄的死，信长包围网出现了一个突破口。信长迅速在岐阜集结兵力，并命手下的丹羽长秀在近江附近的琵琶湖建造大船，准备水陆并进消灭在京都二条城公然反叛的足利义昭。1573年7月，100只大船建造完成，加上返回的援助德川的兵力，信长集结了2万之众。在这期间，他也接待了来自武田家的使者，武田二十四将之一的小山田信茂。由于信长在1568年上洛的时候曾跟武田信玄结盟，所以武田家对三方原之战信长派援军支持德川家表示不满，特派使者来准备与织田家正式宣战。信长也知道自己想要夺取天下，武田是必须打败的对手，也就接受了。不过对方使者的礼物却让信长黯然泪下，那是在三方原之战牺牲的平手泛秀（平手政秀三男）的首级。但相反的这件礼物也激励了织田军的士气。
得知武田军撤退的足利义昭，依然没有放弃抵抗。一方面加紧联系浅井、朝仓等反信长势力，一方面也不断的向松永久秀寻求援军。足利义昭手里不过几千人，所以最后决定逃离二条城。7月6日信长登上造好的大船，从水路出发，只用一天就到达二条城，二条城守将三浏藤英奋力反抗，但还是最终不敌，城池于7月12日陷落。这时的足利义昭已经逃到了自己认为固若金汤的槙岛城。这几天连降大雨，义昭在城中喝着闷酒，心情怎么也好不起来。而城外，信长一马当先，带领着织田军渡过了槙岛最后的屏障——宇沼川。在信长的猛攻下，槙岛城2日就陷落了。
信长活捉了足利义昭，本意杀了这个小人。但曾经是义昭部下的明智光秀和细川藤孝极力反对，一时难以抉择。两人看说服不了信长，立刻向上请示天皇，最后由天皇来调停此事。结果由足利尊氏开创了190多年的室町制幕府正式灭亡，足利义昭遭到了放逐。
这件事震动了整个日本，之前反叛的松永久秀等人再次归降了信长。许多家臣怕其日后再反，建议信长杀掉久秀。信长笑言：“久秀是个枭雄，谁强自然就会归附谁，谁强就能借用他的力量，现在还不是跟他作战的时候。“京都地区基本已经平定，信长交给村井贞胜留下料理京都的后事。自己又乘船来到了身处北近江正与浅井长政对峙的虎山御前城堡。
在此负责对浅井家攻略的正是猴子——木下藤吉郎。通过这段时间的攻略，他已经把浅井的小谷城完全包围，并说降了浅井家的重臣阿闭贞征。信长特意叫来了竹中半兵卫，三人一起商量对策。半兵卫说道：“现在我们跟浅井呈围城之势并在不断调略对方的武将，但是能挖过来的已经都挖过来了，剩下的海赤雨三士等人都是死忠于浅井的家臣；另外我们也多次派人与阿市大人联系，但都一无所获，如果攻城战中误伤了您的妹妹那就不好了。”“猴子”插嘴道：“是啊，最让人担心的还是阿市大人。”信长说：“长政是我很欣赏的年轻武将，如果不是他父亲久政复归，也许还不至于背叛我，有什么办法能劝他投降呢？”半兵卫回答道：“依在下看，不太可能，长政虽重义，但更重孝。如果使其降服，必要先说服其父久政，但此事难如登天。”正在三人苦恼之际，负责探查朝仓家动静的柴田胜家来了。
“信长大人，最新消息！朝仓义景不听家臣们的劝阻，派出2万大军前来援救小谷城！”半兵卫笑道：“名门朝仓家的劫数到了”，信长不解，“我知道大人用兵迅速，在京都打败义昭后，肯定会转向浅井和朝仓，不给他们喘息的机会。所以不久前与木下大人商量，特意放跑了浅井派去朝仓家求援的使者。朝仓家祖上均为名将，老将朝仓宗滴70高龄还曾征战沙场，虽经历几败但还不以动其根本。所以必须将其军队诱出越前，进而消灭。可惜现在的当家朝仓义景在父辈的溺爱中长大，是名浪漫主义诗人，必会倾全家之力来救援浅井的。”听完半兵卫的计策，信长钦佩不已，有着这样能配合自己行动的家臣真是难能可贵。“好吧，那就先打朝仓，我们在这以逸待劳，围点打援。胜家，说说详细的情况吧。”
原来前美浓的领主斋藤龙兴跑到了朝仓家，以他为首的山崎吉家、河井宗清等人为主战派主张跟信长决一死战。而以朝仓景镜及鱼住景固等为首的是主和派，希望休养生息。朝仓家内部已经产生了分歧，对于姊川和比睿山的大败，许多人也已经不再信任朝仓义景。
1573年8月，朝仓援军在大岳砦集结。许多将领虽然接到了朝仓义景的命令但也未派兵前来，这使朝仓号称的2万人大打折扣，也使得朝仓军的士气低落。8月12日，信长率领柴田胜家、前田利家、佐佐成政等人借暴风雨之势对朝仓军发动奇袭，朝仓军大败而逃。信长下令追击，一鼓作气攻入越前朝仓家的领地，在刀根坂再次与朝仓军交战，获得大胜。此时小谷城的浅井得知朝仓援军的消息，欲出城牵制信长，谁知猴子和半兵卫早有准备，全歼了杀出城外的士兵。斋藤龙兴、山崎吉家、山崎吉延等人相继战死，等朝仓义景逃回一乘谷城的时候身边只剩不到10余人，仅仅3天的时间2万大军变成了不到10几个人。义景连忙向之前反战的诸将救助，最后只有同族的朝仓景镜率兵前来协助其守城。8月16日，义景又觉得不保险，逃离一乘谷城，来到了曾是信长包围网的盟友本愿寺的据点东云寺。谁知寺里的僧人在得知对手是织田信长后不敢收留他，僧人的原话：“信长连比睿山都敢烧，何况我们这座小寺。”就在义景四处逃亡的时候，负责留守一乘谷城的朝仓景镜不敌柴田胜家的攻势，开城投降。8月20日，在不知情的情况下，义景在贤松寺被同族的朝仓景镜攻击，自尽而亡，享年41岁。义景的头被信长安排在京都狱门暴晒。其母亲、儿子等亲人皆被信长处死，朝仓政权正式灭亡。朝仓景镜因为有功可以保存名字，把朝仓的姓流传下去。
足利、朝仓都是过去英雄辈出的家族，最后也难逃灭亡的厄运，对子代的溺爱不止会断送孩子的命运，甚至连祖宗的家业也会被断送。历史总在重复的上演，织田家最后的灭亡也跟信长的蠢孩子们有着十分重要的联系。
除了远在大坂（由于“坂”字有反土之意思，明治时代改为“大阪“，本文中为大坂）湾的石山本愿寺的和尚外。小谷城的浅井长政是信长包围网的最后一个敌人了。信长留下柴田胜家和朝仓家的降将处理战后的事宜，自己于8月26日回到虎山御前城堡。“猴子，三天之内攻下小谷城！”“啊？”木下藤吉郎吓了一跳，“有半兵卫帮你，应该没问题的。跟稻叶山城比起来，小谷城就像玩具一样。”“那也就是说由我指挥这次作战了？”“恩，交给你了，我会部署其他人配合你的。”“是，我一定完成任务。”猴子欣喜若狂转身刚要走。“另外，阿市的话……”“恩，属下明白。”
翌日清晨，猴子、竹中半兵卫、蜂须贺正胜带领着自己的部队离开了虎山御前，朝着小谷城进军了。